Aún no ha salido una versión del último Clony traducida al castellano, pero no te apures, porque no tardará, seguro.
En cuanto a la posibilidad de ocultar CD-R, es una opción que viene con las últimas versiones del CloneCD que tienen como finalidad "ocultar" a los ejecutables de los juegos que se está tratando de ejecutar una copia y no el CD original, ya que uno de los "trucos" de los ejecutables es detectar si se está rulando un original o una copia, leyendo el ATIP, y si detecta que es una copia, no carga el juego. Mediante esa opción, se engaña al ejecutable haciéndole creer que se está ejecutando el original del juego en cuestión, por lo que permite hacerlo funcionar. Esta es la explicación más simple de esa función, aunque supongoque los más expertos podrán darte más explicaciones al respecto.