Lo normal con las copias de seguridad es pillar algun software y limitar carpetas (mis documentos, imagenes, videos, música, escritorio...) Y dejar que sea el software el que se lo curre (las copias "incrementales" están para eso, para no copiar lo que ya existe en destino).
Cobian no se si te serviría, me suena que hace copias de seguridad, no sincro de carpetas, lo mismo te lo pone de una forma que no te gusta.
Por otro lado windows tiene "xcopy" que te puede ser útil via comandos (o un .bat) ya que tiene el parámetro /d con el que le puedes decir que copie lo modificado a partir de cierta fecha o, si no le pones fecha, te copia todo lo que ha cambiado (ahorrando el tiempo de copia de cosas que ya existen y no se han actualizado).
https://docs.microsoft.com/en-us/window ... ands/xcopyUn archivo .bat típico sería:
xcopy c:\users\****\Desktop e:\backups\Desktop /d /y /e /i
xcopy c:\users\****\Downloads e:\backups\Downloads /d /y /e /i
xcopy c:\users\****\Pictures e:\backups\Pictures /d /y /e /i
xcopy c:\users\****\Videos e:\backups\Videos /d /y /e /i
xcopy c:\users\****\Music e:\backups\Music /d /y /e /i
xcopy c:\Programa1\ e:\backups\Programa /d /y /e /i
con esto y ejecutarlo ya tienes suficiente, no para esta copia si no para todas las que vengan. El parámetro "/d" ya se encargará de no repetir la copia de archivos no modificados.