Supongo que te habrás bajado Pdf Reader Pro, Felaur PDF o alguno parecido. Requisito indispensable: wifi, y tener conectado tu ordenador y tu iTouch al mismo. En el pc, arrancas tu explorador y pones una dirección tal que 192.168.1.36:8080 (es un ejemplo, el programa debería decirte cual es la ruta). Desde ahí cargas tus pdf's. Y no, aunque existe una app que se llama memory stick, un ipod touch no funciona como un pendrive. Pero quizá te pueda ayudar un programita que es la hostia: es como el winscp, pero no hace falta internet, y puedes arrastrar todo tipo de archivos. Se llama iFunBox, no te costará encontrarlo.
Espero haberte sido de ayuda.