Bueno, priemro lo correcto es defragmentar no desfragmentar, segundo, ¿te dice que no puedes usar ese espacio?, de lo contrario no deberia de preocuparte demasiado.
Podrias probar con el Sony HDD Tools para "optimizar" el espacio, antes debes de parchear el archivo ATAD.IRX para que reconozca los discos duros que no son los oficiales de Sony.
Podrias darle una revisada al HDD Format.