Cioscorp 3.6 es compatible con Bootmii porque no toca el IOS 34, para instalar el 3.6 solo debes de instalar el IOS34 original previamente bajado con NUSD con la opción "empaquetado wad" e instalarlo con Wadmanager, a continuación instalas la versión 3.6 sin necesidad de quitar la anterior que tengas.
Para actualizar de un Cioscorp a otro solo debes de instalarlo ya que el instalador de Cioscorp lo que hace es meter a saco todos y cada uno de los IOS existentes, pero modificados previamente, y en este caso, como podrás comprobar dentro de la carpeta que contienen cada uno de los IOS, falta el 34.