¿Cómo detectar cuellos de botella en servidor casero?

Veréis... Tengo una modesta placa ARM (1.2 GHz, 512MB RAM) en la que ejecuto un owncloud con:

- nginx
- mariaDB
- PHP5

Y la cuestión es que va bastante lento.

¿Sabéis de alguna técnica que me permita identificar qué es lo que va mal? Sospecho de PHP.... pero me gustaría estar más seguro.

¿Sugerencias?
Si usas Linux, comando top y te muestra el uso de CPU y memoria de los procesos.
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