Bienvenido a mi mundo.
Me pensava que era el unico que le pasava, pero ara vemos que no.
A ver solucionar el problema no lo soluciono, peor al menos puedes engaxar al flash de esta manera. Coloca el homebrew en tu targeta, parcheando de forma normal o sin parchear, como desees ( a mi siempre me han dicho que no parchee, pero normamente lo hago paera crear memoria, aunque es en modo copia directa) y una vez en la targeta, cambia el final del nombre por.ds.gba o gba. Es decir, kita la terminacion nds. De esa manera la targeta no intentara cargar el icono i no dara problemas, podras cargar perfectamente desde el menu normal.