Si quieres que la memoria sea rapidilla, tienes que poner un valor de los siguientes para el combo "Tamaño de unidad de asignación"
Si quieres jugar con backups de GBA:
FAT32
Memoria 1GB=8192
Memoria 2GB=16k
Memoria 4GB=32k
Si quieres la máxima rapidez, y solo juegas con backups NDS:
FAT16
Memoria 1GB=64k
Memoria 2GB=64k
Memoria 4GB=64k
Yo tenia FAT16 y 64Kb pero no podia jugar con mi backup del SuperMario Bros. He puesto en FAT32 y 8192 para mi tarjeta de 1Gb, y van todos los juegos muy bien (de rapidez), y además puedo jugar con mi SMB.
Ah, y no se pierde apenas espacio.
Un saludo,