Has intentado con el ordinario disquette de arranque?
Dentro de unas horas me enfrentaré a esa misma situación, tengo un disco duro montado en la PS2 y debo sacarlo para montarlo en un ordenador, voy a intentar con el disquette y si no funciona usaré un programita llamado Partition magic que se ejecuta mediante disquette o tal vez el mismo programa que formatea el disco para PS2 sea capaz de eliminar del formato, no sé, tendré que probar. Cuando lo haga les diré que pasó.