Un formateo de bajo nivel eliminaria la información que hace que el disco sea reconocido pro la xbox 360. Usa un formato de ficheros especial (creo que era FATX y además tiene varias particiones hechas, y lleva un fichero que es el logo de la xbox o de microsoft que la consola busca al conectarlo.
Si haces un formateo a bajo nivel todo eso se pierde. Creo que hay utilidades que te pueden reconstriur la estructura del disco, ya que hay gente que pone discos no oficiales en la 360, pero tiene que estar estructurado como te digo. Puedes intentar ese método. No te puedo ayudar más porque nunca he optado por esa vía.
Si formateas normal el disco desde la xbox lo único que hace es un formato rápido que no escanea superficie de disco, sólo elimina la tabla de asignación y poco más, por lo que los sectores defectuosos seguirían estando y no quedarían marcados.
Saludos.