Hacer un respaldo en la PC es complicado, debido a que el formato de archivos que maneja la Switch y el PC no coinciden. Lo más cómodo que puedes hacer es:
1. Cambiar la micro SD por una nueva.
2. Al encender la consola, todos tus juegos digitales quedan en modo de acceso directo, lo que debes hacer es descargar de nuevo tus compras.
3. Los archivos de guardado de los juegos se mantienen siempre en la memoria interna de la consola, así que no es necesario copiar nada de una tarjeta a la otra.
4. Si la SD vieja ya no va a ser usada en la consola, lo mejor es formatearla en una PC y te queda una memoria en blanco para otro dispositivo.
Saludos.