Tienes tutoriales del m3 perfect donde explicará todo el tema de guardar partidas.
El salvar en tiempo real está muy muy verde en NDS (acaban de sacarlo,seguramente con fallos todavía, para supercard One y va a salir para Cyclo evolution próximamente ).
Tampoco se exactamente para qué te hace falta, si el zelda te permite guardar en cualquier momento (aunque en algunas ocasiones empiezas al principio del nivel en lugar de justo en el punto donde guardaste, pero vaya, que tardas un minuto en llegar a donde estabas antes de guardar).
La mayoría de los flashcarts guardan directamente a la micro sd, con lo cual no hay que hacer eso de apagar la consola y encenderla para que se escriba el save. No se cómo va el tema de los saves en tu flashcart, así que te recomiendo que te leas el megatutorial que hay en el hilo de tutoriales sobre flashcarts.
saludos!