tienes 2 opciones:
- compartir el linux las carpetas a traves de SAMBA (en gentoo.org habia un tutorial muy bueno, era particular de gentoo, pero te explicaba las cosas muy bien y no seria muy complicado adaptarlo para ubuntu)
- Instalar el sistema de ficheros NFS en Windows, agregando un servicio de red mas, en agregar o quitar componente de windows...