Los ordenadores, de unos años para acá, detectan solitos los discos duros, así que es casi seguro que la bios no tendrás que tocarla.
Y si lo que vas a quitar es el lector, y no tienes mucha idea, lo más sencillo es que lo dejes todo como está, pero sustituyendo el lector por el disco duro. Para ello, sigue los siguientes pasos:
1-Quita el cable cinta del lector y su alimentación, saca el lector.
2-Como dice THe NeW MoRaN, asegúrate de que los jumpers del disco están colocados en configuración de esclavo.
3-Coloca el disco duro, enchufando la alimentación y el cable de datos.
Para ponerlo como esclavo del primer disco duro tendrías que hacer lo mismo pero intercambiando los cables cinta de los dos esclavos. Lo que no te sé decir es en cuál de las configuraciones tendrás mejor rendimiento, pero me da la impresión de que será mejor de esta última forma.
Un saludo y suerte.