A ver lo he solucionado ahora mismo.
A mi lo que me pasaba era que copiase lo que copiase en el HD NO LO VEIA en la consola. En la particion 3 habia la carpeta llena de ceros y una que ponia CACHE. Borre las 2 carpetas y me aparecion de nuevo una llena de ceros en la que aparecian los juegos arcade que habia comprado en su dia y los juegos que tenia instalados, copie los archivos que me interesaban de nuevo y ya se veian en la biblioteca de juegos.
La verdad es que creo que me explique fatal pero si a alguien le pasa lo mismo ya sabe la solucion.