Hola:
Juraria que yo esto lo respondi en otro hilo, pero no lo encuentro, asi que tocara volver a responder.
Supongo que programas hay unos cuantos, pero yo solo he usado uno, el tovid
http://tovid.sourceforge.net/ .
Tiene modo grafico y modo por consola, si tu ordena es rapidillo puedes probar el modo grafico, que creo recordar que era muy simple, solo tenias que elegir los videos, decir el formato que querias (pal o ntsc, y 16:9 o 4:3), si querias menu y como lo querias y el solo te sacaba la iso. Si no son muchos videos y tu ordena es rapidillo es muy facil, si el ordena es lento tendras que hacerlo por linea de comandos ya que por lo menos cuando yo lo probe era imposible dejar el proceso a medias en el modo grafico pero si por linea de comandos, tambien es muy facil pero da un poco mas de palo (yo lo tuve que hacer asi).
Si te apañas un poquillo con el ingles la documentacion de la pagina es suficiente para que lo hagas sin problemas, sino pregunta y intentare hecharte un cable.
De todas maneras al final de la pagina del tovid hay links a programas similares que si no te gusta este podras probar.
Saludos