En la galeria de la 3DS salen los videos y las fotos. En la tarjeta SD puedes meter videos desde el ordenador, como series o peliculas, pero hay dos inconvenientes: los videos como maximo pueden ser de 10 minutos, y que hay que convertir los videos con un programa.
Si buscas en google "3DS video converter" te saldrá el programa y tutoriales para pasar videos a la 3DS, y el propio programa te corta una pelicula en fragmentos de 10 minutos. Por ultimo, decir que puedes convertir videos en 3D y verlos en 3D en la consola.
PD: los videos que quieras meter en la 3DS hay que ponerlos en la carpeta donde tienes guardadas las fotos y videos que ya tienes (DCIM creo).
Espero haberte ayudado, aunque en el tema de reproduccion la cosa esta muy verde.