En 3.55 funcionan casi todos de forma directa. En 3.41 no tanto. De todas formas infórmate individualmente de cada juego.
Y si no lo sabes, pues pruebas. Ejecuta el backup con multiman y conexión de red activada. Cuando entres en el juego te dirá si existe una actualización nueva. Actualizas y espera a ver si carga correctamente. Si es así, ya lo tienes actualizado. Si no, pues desinstalas todos los datos del juego y empieza de nuevo, esta vez sin instalar la actualización.
El tema del pes, es que me parece que actualiza desde psn y ahí no podemos hacer nada.