puedes instalar el paquete kubuntu-desktop para asegurarte de tener todas las aplicaciones KDE necesarias suministradas con la distribución kubuntu, y cargarte gnome-core para desinstalar gnome, y todo lo que dependa de él. No obstante, las librerías gtk y todo eso deberían seguir ahí por si necesitases arrancar alguna aplicación gnome en algún momento.