Yo de ti me ahorraria la opción de reescalar en el GBSc. Sí, suena muy versátil, pero la realidad es que al GBSs le tocara desentrelazar la imagen (y no es muy bueno en ello) y reescalar. Vas a verlo mucho mejor a 480p "nativos" que 480i reescalados a 1080p (o la que quieras).
En mi opinión, 480p CRT > 480p LCD > 480i CRT
Dicho de otra manera, si la consola tiene salida progresiva, intenta aprovecharla. Que yo sepa, solo hay dos juegos que van a 240p, y son dos recopilatorios (el de Zelda y el de Megaman).
Así que lo primero que haría sería intentar probar que tal reescalar tu LCD a partir de 480p.
Si no tienes esa posibilidad te diría que vayas a por un cable RGB. La Gamecube en un CRT se ve muy bien. Es solo que a 480p, en un panel adecuado (monitor CRT, PVM multisync y con algunos upscalers), se ve aun mejor (en mi opinión).