En mi caso yo lo hago con Cubase.
Dentro de las opciones de ventana se puede hacer que las sub-pantallas y barras de herramientas "puedan flotar" y no tengan que estar ancladas de la ventana "padre" del programa, con lo cual puedes mover lo que quieras a cada monitor. Con esto te quiero decir que en cada aplicación será distinto. No deberías buscar un programa, sino mas bien el manual del secuenciador que estés usando para ver si soporta múltiples monitores y como se activa. Un saludo!