Ya lo he solucionado.
Lo he arraglado usando sudo, pero haciendo una pequeña modificacion, creo que en el fichero sudoers:
Primero he ejecutado visudo como root y he añadido al final del fichero esta linea:
mi_usuario ALL =(root) /usr/bin/mtink
De esa forma sólo ejecuto el mtink como si fuera root escribiendo sudo mtink.
Pensaba que haciendo esto también podrían ejecutarse otras cosas con sudo, pero he comprobado que no.
Creo que esto he podido hacerlo asi porque uso Debian y no tiene activado el sudo por defecto.
Saludos.
EDITO:
La línea que añadí estaba incompleta, la correcta es
mi_usuario ALL =(root) NOPASSWD: /usr/bin/mtink
De esa forma no se solicita contraseña al ejecutar sudo mtink