Había una lista de 13 juegos de PSX que no eran compatibles con PS2: creo que el más conocido era el Wing Commander 3.... el resto eran "rarezas".
Luego está el caso de juegos como el Metal Gear: VR missions que al final del juego parece que tiene un fallo ( no recuerdo bien cuál era... creo que tenía que ver con grabar la partida ).
En general, la compatibilidad es muy buena, aunque si se activa la opción de leer el disco más rápido es cuando puede surgir algún problema..... yo normalmente sólo activo el suavizado de texturas.