Desconozco pudiera funcionar pero todo parece indicar que no.
El lector de ezflash 2 está pensado para leer y escribir la memoria flash de un cartucho de gba, no acceder a una tarjeta SD (o miniSD).
Tendrás que buscar un adaptador de minisd a sd y leer la tarjeta desde un pc o comprar un pack de esos que venga microsd y adaptador a mini y sd.