probablemente tendras que adaptarlo para que compile en linux , a no ser que no haga uso de ninguna libreria extraña. prueba con el gcc a ver si cuela y si no , a pelearte con el codigo.
gcc -o nombredelprograma nombredelprograma.c
edit: de paso , pega el codigo si no es muy grande. poco queda ya de mi conocimiento como programador , pero igual puedo indicarte alguna modificacion.