Siento disentir, KDevelop actualmente es el mejor IDE para C++ en particular que existe sobre *nix.
Desde las herramientas que trae, la documentación, el soporte simultáneo para varios lenguajes, la integración con diff, con los sistemas de versiones CVS y subversion, el visor de clases, la integración con Umbrella, en fin todo. Si es que sirve hasta para editar PHP, y "ejecutarlo" en una pestaña.
Anjuta lo he usado también mucho hasta la aparición de Kdev 3 (el anterior apestaba), pero ahora ni punto de comparación.
Respecto a los scripts, cualquier IDE te va a generar todo eso. Así el que vaya a compilar en otro sistema, sabrá que librerías necesitará o lo que sea, y hacer el típico ./configure y make.
Si lo único que quieres es hacer un pequeño programa y compilarlo a pedal, usa vim o Kwrite, y otra consola para compilar.