¿Quizás lo estás exportando con una resolución mayor que la original, en alguno de los pasos? Podrías probar a revisar a mano el framerate, la resolución, las codificaciones de vídeo y audio, etc; a ver si en alguna parte del proceso te lo ha inflado.
También puedes recodificar el vídeo final a un formato con una compresión mayor (puedes usar ffmpeg, donde controlas a mano todos los parámetros).