Yo también tengo ambos, y me resulta una difícil elección.
A mi me encantan los dos porque me aportan algo distinto, por el hecho de que por su modo de jugarse en ambos casos se puede decir que sólo se pueden jugar en la DS (algún purista dirá que hay ports del zookeeper a otros sistemas y es cierto, pero la verdad es que no hay color jugandolo con el stylus).
Así en resumen, te diré que el meteos es un juego más "sólido" y con más "profundidad", y el zookeeper es más sencillo e inmediato, de ahí que haya gente que le parezca un poco repetitivo. En ambos casos son adictivos (y cuando los manejas con soltura, frenéticos) a tope.
Mi consejo, aunque sé que no es lo que esperas leer, es que te cojas los dos.
Saludos.