Como han dicho, el principal problema está en la placa base (VRM con 4 fases para el VSOC + 1 para el NB), cuando se recalientan bajarán el rendimiento del procesador y será lo que notas.
Placas AM3+ con más de 5 fases disipadas para el VSOC, al menos en España, son difíciles de conseguir de segunda mano , y encontrarlas nuevas directamente es un mito.
Pilla unos perfiles disipadores de aluminio, que salen por cuatro duros, y pónselos sobre los mofsets. Algo mejorarán.
Para lo del cuello de botella, no me fiaría de otra cosa que no fuese el MSI Afterburner mientras pruebas unos cuantos juegos (unos tiran más de CPU, otros de GPU, otros tiran demasiado de disco...) y sacar tus propias conclusiones.
Sobre el papel, tanto procesador como gráfica están en el mismo nivel, de modo que en teoría no deberías tener eso que llaman "cuello de botella".