A mi también me interesa mucho este tema...
Según el hilo de gbatemp es posible, aunque no me queda muy claro si se pierden los savegames o no. Tampoco queda muy claro lo de formatear la emunand en el momento en que el proceso de transferencia falla. A ver si alguien que haya hecho la prueba nos puede aclarar un poco sobre el tema.
También esta este otro hilo:
http://www.elotrolado.net/hilo_a-vueltas-con-la-emunand-y-traspasarla_2079754 Por lo que parece, restaurando el la emunand del sistema origen es posible seguir usando los juegos de la eshop en el sistema antiguo.
La verdad es que hacer la transferencia a emunand me da un poco de cosa, ya que tengo bastante dinero gastado en el eshop y no me hace gracia perderlo o depender de gateway para jugar a mi software original... Si más tarde quisiese actualizar la sysnad de la new3ds no tengo claro si al hacer la transferencia a emunand el ID de consola coincide con el de sysnand y ya se queda enlazado a mi NNID y podría hacerlo actualizando la sysnand normal, o si tendría que flashear la emunand a la sysnand para conservar mis juegos, etc...
A ver si alguien no ilumina...
