En pantalla completa pueden haber problemas si no cargas bien el módulo extmod en el XF86Config.
Por otro lado mira a ver si tienes bien definido el rango de resoluciones y de frecuencias, es decir, que para cada profundidad de color, tengas definidas todas las resoluciones posibles, y que tengas también el rango de frecuencias horizontales y verticales exactas de tu monitor.
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