Yo tengo mi Macbook Pro 13" conectado a una pantalla externa, y le cierro la tapa. Lo tengo mediante MiniDisplayPort -> VGA. Lo que hago, es tener todo conectado de inicio, cuando estoy en Mac y me detecta la pantalla externa, no hago que me la clone, sino que la use como escritorio extendido, le pongo su resolución (Full HD) y listo.
Después de configurarlo, para usarla sólo tengo que iniciar el Macbook con la pantalla abierta, cuando inicia el sistema y acaba de cargar y veo que se ve el escritorio extendido en la externa, cierro la tapa, se queda la externa en negro y me dice que no hay señal, hago un click del ratón, y a los 2 segundos ya tengo la imagen solo en la externa.