Seamos un poco mas especificos :
¿A que te refieres con que no los lee, que directamente del logo (pasa poco tiempo) hace un ruidete y se sale a la bios o que cuando lo metes, arrancas, suenan ruidos durante un buen rato y luego te saca a la bios?
Mi "estupido-solución" para este caso sería que usases el CDI2Nero y probases directamente, ya que la forma de arrancar de los discos cuando se graban con el nero es mas limpia que con el Diskjuggler, la mas "burra" es la del clone en la mayoría de los casos, pero los discos grabados de nero -> clone van de perlas.
Igual no me se explicar bien, pero a una mala prueba con imgburn, que tambien me ha dado siempre muy buenos resultados.