Resumen rápido:
Steam: Es tienda y plataforma. Puedes comprar juegos, jugar online, logros, comunidad, capturas, etc etc. Es la más popular y donde hay prácticamente de todo menos exclusividades varias.
Origin y Uplay: Son tiendas y plataformas también, aunque son las que tienen las exclusivas de EA y Ubisoft.
Battlenet: Lo mismo, pero para los exclusivos de Blizzard.
Desura: Igual pero para juegos MUY indie casi exclusivamente. Yo principalmente lo he utilizado para rarezas, mods y juegos opensource.
GOG: Tienda de juegos retro y también de algunas novedades principalmente indie, todos en formato DRM-free, vamos, sin sistemas anticopia. Se supone que tendrá plataforma (no obligatoria) en un futuro cercano.
Humble Bundle, Groupees, Indiegala, BundleStars: Páginas de packs de juegos indie en su mayoria a precios muy rebajados. Suelen tener tienda también. Humble suelen ser de calidad buena, pero luego en las otras hay packs buenos pero tambien muchos packs de juegos muy malos. Si te dejas llevar, compras todo tipo de mierda, porque viene en un pack a 3€ tirao de precio
DD
Amazon, GMG, Gamefly, Gamestop, Nuveem, etc... : Tiendas "oficiales" que venden claves para jugar en Steam, Origin, Uplay. Algunas son de un determinado pais y tal.
G2A y similares: Tiendas de claves pero no tan oficiales como las otras.
Mercado de traders: Gente que intercambia juegos en formato Steamgift principalmente, pero también claves y tal. La moneda habitual suele ser objetos del Team Fortress 2 que puedes comprar en el mercado de Steam.