Siempre te va a bajar el rendimiento por un simple motivo: Tu ordenador está trabajando más.
Otro tema es que tengas los FPS limitados y vaya «sobrado» como para hacer otras tareas, pero si lo tienes «a todo lo que da», pues cuanto más trabajo le des menos FPSs va a poder sacar.
Lógicamente, cuanto menos resolución de lienzo y de salida pongas pues menos bajará, pero bajará porque le estás pidiendo trabajar más, tanto a la gráfica como al procesador, RAM y disco duro.
Otro tema es si te baja «demasiado».