lo primero, para poder usar el cartucho azul de nds deberas poder usar el rojo ....asi que tendras que hacer uso de un Zelda Ocarina of time con el exploit del save modificado para poder entrar al modo gateway y cargar roms....una vez que llegaste a este punto y puedes usar tus backups y demas, debes instalar un archivo CIA llamado timewarp (que tendras que buscar con google) que quita el bloqueo a los flashcart de ds y asi poder hacer funcional el cartucho azul de Gateway.
Hay que hacerlo antes de crear la emunand (para que se aplique a la sysnand y no en la emunand), cargar el devmenu o titlemanager de BigBluebox en formato 3ds desde el menu de roms de Gateway e instalar el CIA timewarp.
Eso es a resumidas cuentas lo que hay que hacer, si algo no te suena de lo que he nombrado en el foro tienes todas las respuestas ^^