Conversor MKV a AVI

Si dijeras al menos el sistema operativo que usas...

mencoder, ffmpeg

Avideux.
Multiplataforma y se traga todo.

Sorry Uso Ubuntu de S.O

Con Avidemux lo puedes hacer, si usas ubuntu lo puedes descargar desde el centro de software.

Avidemux no es recomendable para trabajar con MKV, las opciones de amuchamu van mejor.

Usa el mencoder, es rapido y simple. Sirve en cualquier OS Linux, Windows, OSX..etc

Abre una terminal, y escribe

mencoder video.mkv -oac mp3lame -ovc copy -o salida.avi

Lo que hace ese comando, es convertir el mkv a un avi, sin recodificar el video, y recomprimiendo el audio a mp3

Asi no perdes calidad, pero tenes un avi compatible

En caso que quieras recodificar video, por ejemplo a xvid, el comando seria mas o menos asi

mencoder video.mkv -oac mp3lame -ovc xvid -xvidencopts pass=2:bitrate=800 -o salida.avi

Espero te sirva