Asignar carpetas cuenta de usuario contraseñas ......
Vamos a ver una makina linux se puede incluso como te han dicho , meter al directorio activo , es mas si quieres puedes hacerlo pdc de directorio activo , usar ldap samba como gestor de cuentas y permisos , pero vamos , la pregunta aqui es a nivel de sof pq necesitas que sea hibrida , que quieres que hagan esos servidores y pq necesitas tener ambos sistemas. Es un poco locura dsde nivel administrativo mantener eso, para tareas basicas ojo.
en fin cuentanos mas , que tipo de red cuantos ordenadores , cuantos usuarios , que quieres hacer comaprtir ficheros , copais de seguridad que otro tipo de servicios ?
saludos