Wenas Nanoxxl:
Lo que te pasa es completamente normal, a todos los que hemos hecho el mod de alargar el disipador nos ocurre.
El aire del lado de la gpu sale mas caliente sencillamente porque la gpu se calienta más, lo que pasa es que antes el calor se quedaba dentro al no haber apenas succion por parte de los ventiladores y ahora, al alargar el tubo la succion llega bien y lo saca.
No te preocupes porque eso es bueno, solo estas sacando el calor que antes se quedaba dentro al no haber apenas corriente de aire.
Un saludo.