Perder es inevitable en menor o mayor medida, por las diferentes compresiones por la que pasará (la del formato original, la del editor y la de youtube que la web de youtube suele tocar tambien el video)
Así que al menos en la parte que tu puedes controlar lo mejor es usar el mejor codec posible (h264/AVC es el que actualmente se suele usar) con un bitrate alto (sin que el tamaño del video se te convierta en un problema para subirlo a youtube, ya que a mas bitrate mas calidad mayor tamaño)
