No existe el mejor, existe mas adecuado a ciertas necesidades.
Clonezilla cubre la posibilidad de clonar 500 equipos simultáneamente en 15min, perfecto para grandes despliegues ademas de poder usarlo para uso profesional sin coste alguno. Pero en desventaja tiene una interfaz tal vez algo mas compleja que la que ofrece por ejemplo EASEUS, Acronis, Comodo, Redo Backup, etc.
Otros tienen mejor interfaz, mejor integración con el sistema, etc, etc.
Así que es ver que mejor se adecua a tus necesidades.