Lo lógico serían sus fracasos con Jason Todd y, por supuesto, con su hijo Damian. Y, además claramente, la muerte de sus padres. Pero estos serían traumas, no debilidades y además no sorprenderían a Superman.
Yo creo que su debilidad es que está enamorado de alguien y el nombre de esa persona sería lo que está en la caja. ¿apuestas? Selina Kyle y Wonder Woman. Ya lo rematadamente loco sería que fuera un hombre (el mismo Clark, Dick Grayson o Alfred xD).
De todas formas no he leído ese cómic aún porque lo sigo por los tomos cuatrimestrales (que por cierto me tienen que llegar los tres primeros mañana) así que cuando llegue podré dar alguna otra teoría.