Depende estrictamente de la fuente de audio cual tendra mas calidad, ambas interfases -HDMI y SPDIF- manejan audio digital, pero HDMI tiene un ancho de banda superior al SPDIF con lo que puede llevar audio sin compresion de 8 canales [7.1] mientras SPDIF solo puede llevar audio con compresion de 6 canales [5.1], claro que un televisor HDTV puede manejar solo 2 canales de audio.
Como sea, usa el HDMI si es para llevar el audio al monitor, es mas comodo el tener menos cables y para usar solo dos canales de audio da lo mismo SPDIF que HDMI.