Hombre, yo veo una tontería instalar dos distribuciones
¿para qué instalar dos veces lo mismo? La única diferencia real es el modo de hacer las cosas, y no todas, sólo algunas (en entorno gráfico quiero decir).
Yo creo que lo mejor que puedes hacer es:
* partición SWAP de 512MB (creo que hay de sobra).
* partición EXT3 de 10GB (digo 10GB porque lo han dicho los demás, yo en mi Debian uso una partición de 5GB) para montar /.
* partición EXT3 para el resto de espacio para montar /home.
En cuanto al orden de las particiones... ahí me pillas
Yo siempre he dejado la swap para el final, pero no sé si es mejor o peor.
Y nada, luego ya instalas el gestor de arranque (LILO o GRUB) para elegir si entrar a Windows o Linux.
Y respecto a la distribución, pues yo te diría que SuSE o Kubuntu.
Saludos!
PD: No sé que escritorio lleva por defecto SuSE, pero entre Ubuntu y Kubuntu, me quedo con la K