Es posible que futuras actualizaciones impidan usa flashcard, pero para esto también pueden actualizarse los flashcards, el caso es no ir como loco a actualizar e informarse de que ésto no va a dar problemas (como hacemos en Wii).
Por orta parte, aunque en un futuro con juegos DSi puede que no funcionen o que no sean capaces de ejecutar backups de DSiWare y demás, las flashcards de DSi funcionan muy bien (en mi caso ningun problema) con juegos de DS, por lo que creo que merece la pena comprar una. Que dentro de un año todo cambia y hay que pillar otra? Bueno... pues serán 20 euros que has aprovechado hasta entonces. Creo que no es una perdida muy grande.