si estas seguro que no tiene virus el software (no se te habrá infectado el instalador?) puedes hacer lo siguiente.
en general, todos los antivirus tienen una parte donde puedes especificar las excepciones de monitorización/escaneo. agrega el directorio/ficheros del software del flatmii (los que te han saltado con aviso de virus) en el antivirus y después de eso ya te dejará ejecutarlo sin problemas.
nota: con esto te quedarás con ese/esos fichero(s) desprotegidos para un ataque de antivirus.
también puedes intentar contactar con la gente del flatmii para avisar del problema, y enviar un reporte al soporte de tu antivirus para que excluyan este software de la lista negra en la que se encuentra.
por cierto, que virus dice que tiene?
adios 
, sin embargo el nod32 no !! 
