Da problemas el usar siempre Linux por Wubi?

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Hola gente , pues tengo un pequeño problema, ya que no se exactamente como poner para que mi netbook arranque desde USB asi que he pensado que quizás, si no logro solucionarlo podia instalarlo "para siempre" desde Wubi .Esto ocasiona algun problema?
A parte de la imposibilidad de Suspender tiene alguna otra diferencia?
El acceso a disco es más lento, sobretodo si está fragmentado, y si casca Windows y tienes que reinstalarlo pues es un programa más, se pierde.

Si lo vas a instalar para usarlo bastante, no sólo para probarlo o usarlo puntualmente, lo suyo es en partición aparte si puedes.
Es solo cambiar el orden de arranque en bios o en algunos pulsar una tecla (suele ser F12) en el arranque para que salga un menu de seleccion.

Quizá tu problema no sea que no consigues arrancar desde USB, sino que lo que usas para arrancar no esta correctamente montado (¿un USBpen?)
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