No, solamente tienes que tener el .ini con el nombre correcto, bien configurado, en la raiz del discoduro usb, pudiéndolo modificar las veces que quieras, la nand no se toca para nada.
Seguramente tienes un nombre incorrecto del .ini o mal configurado.
Pásate por el hilo oficial, que están respondidas todas estas dudas y puedes encontrar en que te equivocas.
Saludos.