El problema está en que si la versión es NTSC y tu consola no lo es, las flechas van desacompasadas con la música.
A mi me pasaba en PS2 con el DDR Max 2 y el Extreme version JAP.
Quizás también si usas un conversor de NTSC a PAL, o algo similar ( es decir, si el juego en NTSC "puro" para entendernos" ), también te va a ir desacompasado.