Mira, lo del soporte del Spanish Dub del AC3, si no me equivoco es para multiplexar video con archivos .ac3, ya que cuando eliges audio, aparece como fuente ac3 audio, mp3 audio, ogg audio etc.
pero nada mas que es eso(creo, porque en el VirtuaDub Ac3 pasaba eso)pero no es capaz de recomprimirlo.
Utiliza Headac3he para pasarlo a wav, de tal forma que luego en el Spanish Dub elijas ese archivo wav como fuente de audio,y que seguramente si sea capaz de recomprimir a mp3.